厲以寧認為，農村產權制度改革勢在必行，尤其是宅基地管理制度。
以創新精神、探索勇氣加快破除城鄉二元體制。改革開放30年成就舉世矚目，但還有一個大的問題沒有很好解決，就是對于幾十年來形成的城鄉二元體制的改革相對滯后，導致城鄉發展不協調，城鄉差距呈擴大趨勢。統籌城鄉發展最重要的任務就是改革城鄉二元體制，這是中國下一輪改革發展的重點，也是一場偉大的社會變革，為此需要付出巨大的努力和艱辛。
必須開展前瞻性理論研究和理論創新，在理論上率先突破，擺脫一切束縛城鄉二元體制問題解決的思想桎梏，在全社會營造改革城鄉二元體制的氛圍；必須在政策、法律、制度、文化等諸多方面進行有利于推進城鄉一體化的變革，盡快扭轉城鄉差距擴大趨勢；必須勇于探索實踐，統籌城鄉試驗區要大膽改革試驗，開辟一條新路。
在穩定和完善農村基本經營制度的同時，農村產權制度改革勢在必行，尤其是宅基地管理制度。統籌城鄉發展、推進城鄉一體化，最基礎、最重要的在于搞活農村經濟，增加農民收入。當前發展農村經濟面臨的瓶頸問題是農村金融服務嚴重滯后，而農村金融發展的桎梏是受現行農村產權制度的制約，最普遍、最集中、最突出的表現是農村宅基地管理制度，宅基地及其上面建造的住宅既無法流轉，又不能抵押，制約了農民土地權益的實現，不僅不利于農民致富和農村經濟發展，而且不利于農村勞動力轉移，嚴重阻礙城鎮化進程。目前我國法律對農民宅基地的權利保護實際是不明晰、不到位的。
宅基地是農民的重要財產，應鼓勵支持各地探索宅基地流轉和抵押的辦法，保護和實現農民對宅基地的應有權益。農村宅基地的實際使用已經使農民對宅基地的使用權利變成了事實上的長期權利，應該針對這一客觀事實，在法律上予以確認，賦予農民對宅基地的永久性用益物權，這對保障農民土地權益、搞活農村金融具有特殊重要意義。
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